男生叫女孩“小笨蛋”通常是一种亲昵、宠溺的称呼，具体含义需结合双方关系和语境判断，主要包含以下四类情况：

亲昵与宠溺

该称呼常见于亲密关系中，如恋人或好友，表达对对方纯真、天真的喜爱。例如，男生可能因女生迷糊或可爱的举动而调侃，实则强调其独特魅力。

暗示好感或调情

在暧昧关系中，此称呼可能带有调情意味，通过反差萌拉近距离。例如，男生在情侣间用此话时，可能是在用幽默方式表达宠溺或挑逗。

轻松调侃或玩笑

若双方关系亲密且无其他矛盾，该称呼可能仅作为玩笑，针对女生的某个有趣行为。例如，朋友间因女生突发奇想而调侃“笨蛋”，体现友好互动。

特殊情感表达

少数情况下，男生可能因女生展现出传统、无心机的性格特质而使用，表达对其纯粹性的欣赏。

总结：

该称呼的核心是情感表达，具体含义需结合双方关系、语境及语气判断。若为恋人或亲密好友，多为宠溺；若为普通朋友，则可能为玩笑。