金门战役中被俘的解放军战俘主要分为以下两种处理方式：

一、释放回大陆（约1000人）

甄别与释放：

经过政治审查后，约1000名干部、老弱士兵及部分年轻力壮者被释放回大陆。其中50年3月、7月、9月、12月分四批释放，50年7月18日第二批规模最大（529人）。

待遇与结局：

释放后多数被开除党籍、团籍和军籍，回乡务农或被判刑；1983年后复查，90%以上恢复原籍并补发复员费。

二、遣返大陆（约4000人）

接收与改造：

被俘人员被押至杭州、福州等地集训，接受“新生训练”（政治教育），部分年龄较大、受伤或拒绝留台者于1950年分四批遣返。

去向与结局：

部分成为平民，部分被分配至台湾工作；少数因叛变等行为被开除党籍或处决（如田志春）。

三、补充国民党军队（约3000人）

约3000名年轻战俘被国民党接收，编入其军队服役。

注：国民党方面对部分战俘存在隐瞒伤亡数据的情况（如胡琏战报仅提及“九千余人”伤亡）。