朱元璋对杀害刘伯温的行为存在后悔情绪，主要体现在以下方面：

事后的追悔表现

刘伯温去世后，朱元璋曾免除其青田百姓赋税，并封其子为官，以示补偿。此外，有记载显示朱元璋看到刘伯温棺材内的“七个字”后感到惭愧，意识到对刘伯温的猜忌不公。

功臣群体对比下的遗憾

朱元璋在位期间杀戮众多功臣（如胡惟庸、李善长等），但对刘伯温的结局尤为在意。刘伯温作为开国丞相，其才能与贡献远超其他被杀者，朱元璋对其的毒杀更显“杀鸡取卵”。

历史评价的佐证

中等权威性来源明确指出，朱元璋对刘伯温的杀害是“最大遗憾”，甚至有观点认为其“致明朝短命300年”。

综上，朱元璋在刘伯温去世后表现出明显的悔意，但作为统治者，其猜忌本质未改，最终未能改变历史结局。